כוונון לא נכון של פרמטרי PID של מערכת הבקרה יגרום גם למערכת הבקרה לייצר דרגות שונות של תנודה. אם ההגבר הפרופורציונלי של ווסת ה-PID החד-לולאה גדול מדי, הזמן האינטגרלי קצר מדי, זמן ההפרש וההגבר הדיפרנציאלי גדולים מדי, זה עלול לגרום לתנודה של המערכת ולגרום להפעלת המפעיל. למערכות בקרה מרובה לולאות, בנוסף לסיבות הנ"ל, ישנה גם בעיה של השפעה הדדית בין לולאות, בעיות תהודה עקב כוונון פרמטרים לא תקין. לאור הבעיות הקיימות, ניתן להתאים מחדש את פרמטרי ה-PID כך שללולאת הבקרה תהיה מרווח יציבות מסוים מבלי להשפיע על הייצור ולעמוד בדרישות בקרת התהליך.

